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1. Integration of Sequencing and Epidemiologic Data for Surveillance of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Infections in a Tertiary-Care Hospital

   1. Czech-Sioli, Manja
   2. Günther, Thomas
   3. Robitaille, Alexis
   4. Roggenkamp, Hannes
   5. Büttner, Henning
   6. Indenbirken, Daniela
   7. Christner, Martin

   2023 - Forschungsinformationssystem des UKE - frei zugänglich
2. Remdesivir-induced emergence of SARS-CoV2 variants in patients with prolonged infection

   1. Heyer, Andreas
   2. Günther, Thomas
   3. Robitaille, Alexis
   4. Lütgehetmann, Marc
   5. Addo, Marylyn M
   6. Jarczak, Dominik
   7. Kluge, Stefan

   2022 - Forschungsinformationssystem des UKE - frei zugänglich
3. Rapid Automated Screening for SARS-CoV-2 B.1.617 Lineage Variants (Delta/Kappa) through a Versatile Toolset of qPCR-Based SNP Detection

   1. Nörz, Dominik
   2. Grunwald, Moritz
   3. Tang, Hui Ting
   4. Olearo, Flaminia
   5. Günther, Thomas
   6. Robitaille, Alexis
   7. Fischer, Nicole

   2021 - Forschungsinformationssystem des UKE - frei zugänglich
4. Complete Genome Sequence of a SARS-CoV-2 Strain Isolated in Northern Germany

   1. Pfefferle, Susanne
   2. Huang, Jiabin
   3. Nörz, Dominik
   4. Indenbirken, Daniela
   5. Lütgehetmann, Marc
   6. Oestereich, Lisa
   7. Günther, Thomas

   2020 - Forschungsinformationssystem des UKE - frei zugänglich
5. DAMIAN an open source bioinformatics tool for fast, systematic and cohort based analysis of microorganisms in diagnostic samples

   1. Alawi, Malik
   2. Burkhardt, Lia
   3. Indenbirken, Daniela
   4. Reumann, Kerstin
   5. Christopeit, Maximilian
   6. Kröger, Nicolaus
   7. Lütgehetmann, Marc

   2019 - Forschungsinformationssystem des UKE - frei zugänglich
6. Evaluation of Unbiased Next-Generation Sequencing of RNA (RNA-seq) as a Diagnostic Method in Influenza Virus-Positive Respiratory Samples

   1. Fischer, Nicole
   2. Indenbirken, Daniela
   3. Meyer, Thomas
   4. Lütgehetmann, Marc
   5. Lellek, Heinrich
   6. Spohn, Michael
   7. Aepfelbacher, Martin

   2015 - Forschungsinformationssystem des UKE
7. Rapid Metagenomic Diagnostics for Suspected Outbreak of Severe Pneumonia

   1. Fischer, Nicole
   2. Rohde, Holger
   3. Indenbirken, Daniela
   4. Günther, Thomas
   5. Reumann, Kerstin
   6. Lütgehetmann, Marc
   7. Meyer, Thomas

   2014 - Forschungsinformationssystem des UKE